Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB2P29033 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms