Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERBB3P21860 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms