Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRHP20396 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRHP20396 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRHP20396 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRHP20396 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRHP20396 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRHP20396 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRHP20396 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRHP20396 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms