Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CXCL3P19876 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CXCL3P19876 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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