Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF3P17036 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms