Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD4P09016 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD4P09016 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms