Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms