Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYNP07948 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYNP07948 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYNP07948 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYNP07948 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYNP07948 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYNP07948 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYNP07948 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYNP07948 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYNP07948 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms