Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA4P06727 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA4P06727 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA4P06727 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms