Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX58O95786 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX58O95786 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX58O95786 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms