Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLIN1O60240 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms