Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHP2O43745 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHP2O43745 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHP2O43745 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHP2O43745 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHP2O43745 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHP2O43745 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHP2O43745 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms