Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms