Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms