Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C2AO00443 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms