Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF25A6NGN4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms