Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms