Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF330Q9Y3S2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms