Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms