Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms