Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms