Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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