Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms