Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms