Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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HOXC10Q9NYD6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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