Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD3Q9NX63 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms