Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms