Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms