Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAF1Q9H7N4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF1Q9H7N4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms