Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP3Q9H4L4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms