Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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LHX5Q9H2C1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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