Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms