Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COMMD5Q9GZQ3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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