Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms