Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms