Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms