Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CRACR2AQ9BSW2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms