Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms