Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms