Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF6BQ99941 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms