Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms