Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms