Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms