Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms