Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms