Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCG3Q8WXD2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms