Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms