Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA2Q8TDQ7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms