Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL34Q8N239 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL34Q8N239 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms