Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms